Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ndufa4Q62425 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms