Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfap2bQ61313 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfap2bQ61313 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms