Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Klf3Q60980 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms