Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Grik1Q60934 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Grik1Q60934 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Grik1Q60934 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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