Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ripk1Q60855 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ripk1Q60855 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ripk1Q60855 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ripk1Q60855 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ripk1Q60855 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ripk1Q60855 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ripk1Q60855 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ripk1Q60855 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ripk1Q60855 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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