Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cnot7Q60809 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cnot7Q60809 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot7Q60809 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cnot7Q60809 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms