Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mkrn3Q60764 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mkrn3Q60764 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms