Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samhd1Q60710 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samhd1Q60710 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms