Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Foxd4Q60688 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms