Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtprnQ60673 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PtprnQ60673 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms