Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tsr1Q5SWD9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tsr1Q5SWD9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms