Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r196Q5SVD5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms