Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sft2d1Q5SSN7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms