Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim58Q5NCC9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim58Q5NCC9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms