Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Fam208bQ5DTT3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam208bQ5DTT3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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