Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Trp53i11Q4QQM4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trp53i11Q4QQM4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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