Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Carmil2Q3V3V9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Carmil2Q3V3V9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms