Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

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Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Dnah12Q3V0Q1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Dnah12Q3V0Q1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Dnah12Q3V0Q1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms