Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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