Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znf48Q3US17 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Znf48Q3US17 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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