Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec31aQ3UPL0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms