Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tmem253Q3UNB8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tmem253Q3UNB8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms