Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CrxosQ3UL53 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CrxosQ3UL53 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms