Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gtpbp2Q3UJK4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gtpbp2Q3UJK4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms