Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b2Q3UJB0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms