Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc34Q3UI66 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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