Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Arfgef3Q3UGY8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Arfgef3Q3UGY8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms