Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Lrrc58Q3UGP9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrc58Q3UGP9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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