Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cops9Q3U898 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms