Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1511-202ENSMUST00000214168 1468 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Gtpbp6Q3U6U5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Gtpbp6Q3U6U5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms