Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q3U6N9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q3U6N9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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