Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trappc9Q3U0M1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms