Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ogfod1Q3U0K8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms