Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hace1Q3U0D9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms