Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Hhla1Q3TYV2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hhla1Q3TYV2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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