Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cul4aQ3TCH7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cul4aQ3TCH7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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