Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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