Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ptcd3Q14C51 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms