Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pglyrp4Q0VB07 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pglyrp4Q0VB07 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms