Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ncf1Q09014 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms