Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
AmbpQ07456 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms