Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp2Q06649 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Sh3bp2Q06649 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Sh3bp2Q06649 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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