Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kcnb1Q03717 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kcnb1Q03717 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms