Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tff2Q03404 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms