Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms