Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top2aQ01320 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms