Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Il6stQ00560 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms