Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
F8a1Q00558 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
F8a1Q00558 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms