Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GabpaQ00422 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms