Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms